本成果属于计算机辅助药物分子设计领域，创建了系列不借助任何实验参数及毋需样本构象重叠的药物分子结构参数化方法：高效表征药物分子结构特征的药物分子结构参数化方法--基于虚拟蛋白质受体原子探针的分子表面随机采样分析方法；高效表征药物分子结构特征的药物分子结构参数化方法--三维全息原子场作用矢量等。所构建的新方法克服了目前药物设计领域提出的二维分子结构表征方法难以表达药物配基与受体间立体作用，而高维方法在不同程度上有参数选取随意、计算过程复杂、构象重叠困难等的不足。成果内容：第一，设计药物分子性质高效表达方法。基于典型抗艾滋病药物分子结构，将分子中原子按其化学性质差异进行细致分类；综合电子、立体、疏水、氢键、电荷转移等效应，构建能包含丰富药物分子势能分布信息的描述子。第二，揭示药物分子结构与活性间显著相关规律。以多种化学统计学方法建立抗艾滋病药物结构与药物活性间定量相关关系，同时考查所得模型稳定性。第三，采用分子骨架叠合法、基团修饰、分子对接等方法筛选、设计合成具有潜在应用价值的目标分子。为我国抗艾滋病药物创制取得突破性进展提供了有效手段；为构建高效表征化合物结构描述子提供了新思路。