本发明公开了与大白菜橙色叶球基因Br-or紧密连锁的SSR及InDel分子标记引物及应用。该标记引物的获得是以橙色大白菜和普通白色大白菜及其F2S4分离群体的基因组DNA为模板，通过480对SSR及InDel引物对F2S4中橙色叶球和白色叶球单株DNA混合池进行多态性引物筛选，然后通过对F2S4群体的单株进行分析，筛选与大白菜橙色叶球基因Br-or连锁的分子标记，成功获得了与Br-or基因连锁的15个Br-SSR及3个Br-InDel标记引物，在第9连锁群上（A09）构建了大白菜橙色叶球基因Br-or的分子遗传图谱。连锁分析发现Br-or基因两侧连锁最紧密两标记的遗传距离分别为0.11cM和0.79cM，具有检测方便，扩增稳定，重复性和准确率高等优点。为大白菜橙色叶球性状的分子辅助选择育种提供依据，加快育种进程。