本发明公开了一种从甜瓜藤中通过催化反应分离葫芦素B的方法。该方法步骤：提取过程：甜瓜藤１份，乙醇浸泡回流提取，提取液过滤浓缩成浸膏；催化反应：浸膏加入浓盐酸，再加入六水合三氯化铁搅拌反应，冷却到室温过滤，水淋洗，干燥；精制过程：粗品用醋酸乙脂搅拌溶解，再加入活性碳，脱色，浓缩到小体积，放置过夜结晶；重结晶过程：类精品用乙醇溶解趁热过滤浓缩到小体积，放置过夜结晶，过滤；将精品放置于真空干燥箱中干燥8小时，即得葫芦素B精品。原料来源广泛，生产成本低，降低了酸性环境对葫芦素B的破坏，产品率达60%以上，纯度在99.0%以上，废水BOD在100以下，适合工业化生产循环用水，广泛用于植物提取行业。