消化系肿瘤研究创新团队由樊代明和沈祖尧院士领衔，共培养长江9名、杰青8名。是基金委创新研究群体、国家重点实验室、国家临床医学中心、世界胃肠病组织中国唯一培训中心所在单位，连续6年位居全国最佳专科首位。

坚持基础研究与临床紧密结合，通过成果的积累提出的肿瘤预防、筛查、治疗的序贯策略，获国家科技进步一等奖；通过派出去巡讲、请进来培训，培训全国1.1万名专科医生，为我国消化系肿瘤防治做出了重要的社会贡献。