生物医学信息工程教育部重点实验室是2000年经教育部批准，在原世行贷款建设项目——现代医学电子技术及仪器国家专业实验室的基础上组建。实验室依托于西安交通大学，现任实验室主任为刘健康教授，学术委员会主任为饶子和院士。

实验室现有面积5800平方米，仪器设备总值7800多万元，其中30万元以上大型设备51台套。

实验室现有固定研究人员46人。包括教授19人、副教授18人、讲师5人、实验技术人员3人、管理人员1人。研究人员中，有国家千人计划特聘教授3名、青年千人计划学者1名、陕西省百人计划入选者2名、教育部新世纪人才3名。

近三年来，实验室完成和承担科技部“973”子项课题、“863”与科技支撑计划项目、国家自然科学基金重大国际合作、重点及面上项目等近50余项以及教育部重点项目、国际合作项目、省部委项目30余项。获省部级奖4项。授权专利5项被转化应用。在国内外重要学术期刊上发表SCI论文150余篇，出版学术专著、教材等6本。

实验室与国内企业合作，形成产学研基地、科研合作基地及学生生产实习基地。同时也开展国际合作，成立了西交-雀巢联合研发中心；与NIH、密苏里大学、瑞士Nestle和德国DAAD等开展国际科研合作8项，培养外籍博士后1人、博士生5人、硕士生1人；另有8名德国留学生在本实验室实习6个月以上；与国外大学和研究机构联合培养博士生20多名。