2008年，在前西安医科大学心血管病研究所的基础上，依托陕西省重点学科——西安交通大学医学院第一附属医院心血管内科，经陕西省科技厅批准批准成立陕西省分子心脏病学重点实验室，是陕西省唯一一所从事心血管系统基础和临床研究的重点实验室。

 从上世纪50年代末开始，在老一代学科带头人的带领下，从流行病学、基础理论到临床研究以及人群防治等方面进行积极探索。1958年,为配合开展先心病直视手术,开展了右心导管检查术。70-80年代，与其他研究所合作研制出我国第一代人工心脏起搏器，在此期间,还合作研制了希氏束电极导管，并将此技术用于临床诊断,使心内科在心律失常的诊断和研究方面向前迈了一大步，并于1985年编著了国内第一部有关“人工心脏起搏与电生理学”专著。通过对急性心肌梗塞的基础与临床研究，将心梗住院死亡率降低到7%以下，并荣获1978年第一次全国科技大会科技进步二等奖。在克山病的合作研究中，率先提出“水土病因学说”， 采用补硒和维生素C对其进行防治获得重大突破，荣获国际“克劳斯.施瓦兹奖”。从80年代初开始“八五” 攻关课题“少年儿童高血压易患因素识别”的研究工作，并开展了盐敏感高血压发病机制的系列研究，曾获1995年科技部科技进步三等奖和1999年卫生部科技进步三等奖。

 近年来，根据国家发展目标并结合国际学术前沿和临床工作需要，不断拓宽研究方向，在动脉粥样硬化发生发展、高血压发病机制及防治、心肌病心力衰竭以及心脏电生理心律失常发生机制等方向研究中形成了本实验室的研究特色，已成为陕西省在本领域的科学研究、人才培养和国际交流的主要基地之一。曾获得了国家“973”、“863”“十五”攻关项目和“985”、“十五211”经费的支持，得到多项国家自然科学基金项目、省部级以及国际合作项目多项。目前有7位博士生导师和12位硕士生导师，指导着数十名博士和硕士研究生。近三年分别承担国家自然科学基金12项，其中1项为国家自然科学基金委“杰青基金”。此外，承担省部级科研项目7项。获得科研成果6项，实用新型专利2项，发表学术论文近百篇，其中SCI收录论文39篇。