针对苹果树腐烂病等在我国危害重、防治难、损失大的问题，本项目经过10多年深入系统的研究，取得的主要创新性结果为：（1）发现病菌新种类2个，揭示了病菌入侵扩展过程、致病机理及病害发生流行的基本规律和影响因素。（2）发明了特异灵敏的病害PCR分子诊断技术；建立了快速简便致病性评价方法。（3）筛选出高效防治药剂2种、开发可产业化的生防菌2个，革新了防治技术，发明了简单易行、经济省工、可持久性控制病害的技术方案1套。

本项目出版著作5部，获批国家发明专利2项，申报专利1项，发表学术论文90篇，极大地提升了我国在这一学科领域的整体研究水平。

项目成果通过试验示范、技术指导等，培训农技推广人员和果农累计5万余人次；在陕西苹果主产区推广应用累计445万亩，增收4.4亿元，减少了产量损失、降低了防治成本，具有显著的经济、社会和生态效益。